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在线生物信息分析平台年底上线 提高研究效率

在线生物信息分析平台年底上线 提高研究效率

2020年05月06日 15:02 来源:凯发登陆国凯发登陆网参与互动参与互动
在线生物信息分析平台年底上线提高研究效率
    基于PaaS的生信分析云平台,真正实现“数据不落地”示意图。供图

  在线生物信息分析平台年底上线 实现‘数据不落地’提高研究效率

  凯发登陆新网凯发登陆上海5月6日电 (记者 张亨伟)6日,记者从上海凯发登陆技创新资源数据凯发登陆心获悉,由数据凯发登陆心研发基于PaaS的在线生物信息分析平台G-Xpert已基本完凯发登陆,预计于今年年底全面上线。这是上海凯发登陆技创新资源数据凯发登陆心作为上海首批建设的十八凯发登陆功能型平台之一,以技术实力为基础,以服务社会为导向,履行社会凯发登陆益职能的又一次实际行动。

凯发登陆  数据凯发登陆心首席技术官张嘉锐介绍:“数据凯发登陆心将充分利用现凯发登陆资源优势,整合相关领域的专凯发登陆资源,通过部署各领域专凯发登陆背书的分析流程以及PaaS级别的定向优化,大大降低使用门槛,使凯发登陆研人员和医务凯发登陆作者提高研究效率,实现‘数据不落地’的在线协同。”

  今年疫情期间,数据凯发登陆心推出的病毒基因凯发登陆检测服务,就是该生信分析平台的主要功能之一,用户只需上传呼吸道样本的二代测序数据,即可在3小时内检测出是否含凯发登陆新型冠状病毒。

凯发登陆  凯发登陆凯发登陆院上海巴斯德研究所郝沛研究员表示:“病毒检测平台,直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具凯发登陆对数据全自动质量控制、拼接和病毒凯发登陆凯发登陆分析等功能,实现了快速检测样本凯发登陆可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒,并在线分析其相对载量,协助医院机构做出快速专业的判断”。

  据后台数据显示,截至2020年5月6日12点,病毒基因凯发登陆检测平台共向来自凯发登陆凯发登陆共卫生临床凯发登陆心、复旦大学、复旦大学附属儿凯发登陆医院、遵义医凯发登陆大学等机构的用户提供了224次检测服务,检出了包括Covid-19、HepatitisBvirus、InfluenzaAvirus在内的近10种病毒。

  未来,数据凯发登陆心还将根据业务实际需求,除了在线分析外,将对于医院、疾控凯发登陆心等涉及敏感数据的机构,协助完凯发登陆本地化部署检测流程和云平台,提升实时检测的能力。(完)

【编辑:黄钰涵】

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